Migræne med aura betyder, at man udover hovedpinen oplever syns- eller føleforstyrrelser. Auraen opstår ofte før selve hovedpinen, men kan også forekomme under anfaldet. Cirka en tredjedel af alle med migræne har migræne med aura, hvilket gør den mindre hyppig end migræne uden aura.

Aura skyldes en ændret aktivitet i det yderste lag af hjernen, kendt som hjernebarken. Denne ændring er sandsynligvis en bølge af nedsat elektrisk aktivitet, der starter bagtil i hjernen og spreder sig fremad over hjernebarken, ledsaget af en ændring i blodcirkulationen.

Symptomerne på aura kan inkludere:

Synsforstyrrelser, typisk i den ene side af synsfeltet, som et flimrende, lysende eller mørkt felt, eventuelt med et zigzag-lignende mønster. Disse udvikler sig gradvist og varer typisk 20-30 minutter. Dette er den mest almindelige form for aura.

Herudover kan symptomerne også inkludere føleforstyrrelser, som snurren i fingre eller ansigt, som langsomt kan brede sig over nogle minutter, for eksempel fra fingrene op gennem armen. Dette er den næstmest almindelige form for aura.

I sjældnere tilfælde kan aura også medføre forbigående lammelser (f.eks. i mundvigene), svimmelhed og talebesvær. Auraen varer typisk mindre end 60 minutter, og aurafasen efterfølges som regel umiddelbart af hovedpinen.